Konteneryzacja jest dość młodym rozwiązaniem, więc próg wejścia w nią może być dość wysoki. Szczególnie biorąc pod uwagę, że tworzenie w tej technologii wymaga zmiany podejścia do pisania aplikacji. Mimo, że kontenery wymagają dużo mniej konfiguracji niż maszyny wirtualne, należy pamiętać o kwestiach bezpieczeństwa – gotowe obrazy trzeba stale aktualizować do najnowszych wersji.